النسخة اليونينية اعتُني بها في الطبعة السلطانية عناية جيدة، بيد أن المعتنين بها لم يصرحوا على أيّ النسخ الخطية اعتمدوا! سوى أنهم قالوا: «على فروع جيدة». لكن ما الوصف الماديّ والعلميّ لهذه الفروع؟ وما قيمتها العلمية؟ ومتى نُسخت؟ وأين مكان حفظها؟ لم يفصحوا عن جواب واضح عن هذه الأسئلة، ولا نحن ندري أيضًا مِنْ خَبَرها شيئًا على وجه اليقين!
إضافة إلى أنهم لم يقفوا على الأصول التي اعتمدناها في تحقيقنا؛ ولا على ما اعتمدناه أصلًا في نشرتنا، ولا على أغلب النسخ المساعدة، وأدلة ذلك كثيرة متيقَّنة
فهذا أوّل ما نقدّمه جديدًا في عملنا من جهة الأصول المعتمَدة، وهي ركيزة رئيسة في العمل العلميّ للعناية بأي كتاب تراثي، بل هي أهم مهماته، خاصّة في مثل هذا الكتاب الأصيل. وتحقيق هذه الميزة لِعَملنا استتبع مهمّات كثيرة لم تتحقق في الطبعة السلطانية
إضافة إلى أنه قد وقع لهم تصرفات عديدة في نص النسخة سواء من الشروح أو من نسخ أخرى